Le musée archéologique national, situé à la périphérie de la vieille ville, présente les fouilles de Pompéi, d'Herculanum et d'autres sites archéologiques du golfe de Naples. Il s'agit notamment de trésors uniques, vieux de plusieurs milliers d'années, tels que des sculptures, des mosaïques, des fresques et des peintures.
Le musée se trouve dans un palais conçu par le vice-roi d'Espagne à la fin du 16e siècle et qui devait à l'origine devenir une caserne de cavaliers. À partir de 1612, le bâtiment a toutefois été utilisé comme internat de l'université. Après le départ de l'université à la fin du 18e siècle, le bâtiment a été transformé en musée. Aujourd'hui, il s'agit de l'une des plus grandes collections de pièces de l'Antiquité au monde : l'exposition s'étend sur 12.000 mètres carrés.
Outre une collection de sculptures pouvant atteindre trois mètres de haut, le "cabinet secret" avec des pièces érotiques de Pompéi est également très intéressant. On y trouve des représentations érotiques, des fresques, des figurines et des sex-toys.